Desde sus orígenes, SENER se ha centrado en la Aeronáutica como uno de los mercados en los que podía aplicar su capacidad tecnológica y de innovación.
En la década de los ochenta SENER, con el respaldo del gobierno español, impulsó una nueva empresa Industria de Turbo Propulsores (ITP) que se convertiría en el miembro español del consorcio Eurojet, creado para desarrollar y producir el nuevo motor EJ200 del Eurofighter. Entonces SENER asumió la responsabilidad de realizar la ingeniería del paquete de trabajo español en el EJ200. Durante los noventa, SENER, en calidad de Autoridad de Diseño, se encargó de diseñar la tobera convergente-divergente del EJ200 así como otros elementos esenciales del motor.
Hoy en día, SENER participa en la ingeniería de estructuras complejas fundamentalmente en material compuesto, en la que se incluye la optimización de los procesos de fabricación de piezas compuestas, además de ofrecer servicios de soporte de producto. Asimismo existe en SENER una línea de negocio dedicada al diseño y suministro de máquinas de producción de elementos en material compuesto.

