Gracias a su capacidad de ingeniería y a sus aptitudes tecnológicas SENER participa en la ingeniería de complejas aeroestructuras. En 2002 SENER fue seleccionada para diseñar la carena ventral o belly fairing para el nuevo gigante de la aviación, el A380. SENER diseñó esa enorme estructura, fabricada en su mayor parte en materiales compuestos, y participó activamente durante su fase de certificación. SENER también realizó la ingeniería de otros paquetes estructurales para el programa A380. El trabajo incluía todas las fases posibles del diseño: el diseño preliminar, diseño detallado, análisis estructural, simulaciones de ensayos, ingeniería de producción, apoyo a los ensayos de certificación, etc.
Hoy en día, SENER participa en varios proyectos de ingeniería de aeroestructuras, principalmente en materiales compuestos, para el A400M, B787 y el nuevo A350 XWB.